До початку повномасштабної війни до структури лікарні входили стаціонар на 350 ліжок з допоміжними відділеннями та амбулаторно-поліклінічним відділенням на 750 відвідувань в зміну. Внаслідок збройної агресії рф у закладі значно постраждали головний лікувальний і дитячий корпуси та перехід між ними. Також зазнали руйнувань пологовий будинок, інфекційний корпус, патологоанатомічне та поліклінічне відділення. Було зіпсовано або викрадено побутове майно, високотехнологічне медичне обладнання та санітарний транспорт.

«З жовтня 2022 року за замовленням Департаменту капітального будівництва ХОВА у медзакладі провели ремонтні роботи та відновили зовнішні стіни, покрівлі головного лікувального, дитячого та адміністративно-господарчого корпусів, замінили віконні блоки в інфекційному корпусі. В головному лікувальному і дитячому корпусах та пологовому будинку замінили дверні блоки. Також за підтримки іноземної неурядової організації «Актед» в поліклінічному відділенні замінили пошкоджені вікна. Силами персоналу провели санітарно-технічні й оздоблювальні роботи, відновили відділення анестезіології та інтенсивної терапії», – розповіла заступниця начальника ХОВА Олена Логвинова.  

За фінансової підтримки МОЗ України, Харківської ОВА, Ізюмської РВА, Балаклійської МВА, локальних та міжнародних благодійних організацій, а також за власні кошти для медзакладу придбали лапароскопічну хірургічну стійку, рентгенапарати кількох видів, комп’ютерний томограф, ендоскопічні стійки, апарати ультразвукової діагностики, штучної вентиляції легень, операційний стіл, монітори пацієнта, електрокардіографи, гематологічні та біохімічні аналізатори, аналізатор газів крові, відеобронхоскоп, електрогенератори, функціональні ліжка, меблі, планшети для телемедичних консультацій, лікарські засоби та витратні матеріали. Також закладу передали 3 санітарні автомобілі.

Наразі сталу роботу лікарні забезпечують 22 електрогенератори потужністю від 145 кВт до 3 кВт. У 2024 році на даху дитячого та операційного корпусів встановили сонячні станції.  Впродовж 2024 року за підтримки Міжнародної організації з міграції у медзакладі відремонтували дитячий корпус, відновили зовнішнє освітлення території лікарні. За підтримки Міжнародної організації Червоного хреста в підвальному приміщенні пологового будинку відремонтували системи водопостачання та водовідведення, додала Олена Логвинова.

На сьогодні у медзакладі встановлено 300 ліжок, з них 155 – хірургічного профілю, 145 – терапевтичного, 25 – реабілітаційного і 10 –  паліативного профілю. Функціонує 7 операційних блоків, 9 стаціонарних та 9 допоміжних відділень, а також поліклінічне відділення. До штату закладу входить 548 осіб, з них 97 – лікарі, 232 – середні медпрацівники, 219 – інший персонал. Впродовж 2024 року лікарня прийняла понад 177 тисяч пацієнтів, з них понад 10 тисяч лікувалися в стаціонарі, понад 166 тисяч – амбулаторно. Проведено майже 5 тисяч операцій. У пологовому відділенні народилися 209 дітей – 101 хлопчик і 108 дівчаток. На забезпечення пацієнтів необхідними ліками спрямували 22,2 мільйона гривень. За перші місяці 2025 року в стаціонарі пролікували 1874 особи, провели 796 операцій та прийняли 34 пологи.

Також у 2025 році Балаклійська клінічна багатопрофільна лікарня уклала з Національною службою здоров’я України договір за пакетами медичних послуг за 25 напрямкам. Триває робота щодо розширення послуг за Програмою медичних гарантій, розвиток інноваційних технологій, телемедицини, підвищення рівня комфортності пацієнтів та умов роботи медперсоналу.