Именные стипендии Благотворительного фонда Юрия Сапронова выплачиваются практически со дня основания Фонда – с 2004 года.
Всего за время существования именной стипендии ее удостаивались 114 студентов, многие из них – повторно. Ежегодно стипендии Фонда присуждаются, как правило, троим студентам и одному ученому факультетов естественных наук: «Математика и информатика», «Физика и астрономия», «Биология и экология», «Химия».

С 2004 года размер стипендий вырос с 300 грн. для студентов и 600 грн. для молодых ученых до 1 100 грн. для судентов и 1700 для молодых ученых. В последний раз размер стипендий повышался в 2009 году. Стипендия Фонда Юрия Сапронова по-прежнему является одной из самых престижных в ХНУ.
Общая сумма стипендий за весь период существования составил 806 928 грн. 40 копеек.

В 2010 г. к отбору кандидатов на выплату именных стипендий постарался отнестись неформально: учитывалось материальное положение кандидатов, отмечены особые достижения в науке. Например, стипендиатом 2010 года, решением фонда стал Курбатов Евгений Владимирович, техник отдела космических исследований кафедры экспериментальной ядерной физики, ставший автором изобретения, уже внедренного в производство. Евгений Курбатов формально не подпадал под определение «молодой ученый», тем не менее, Фонд настоял на необходимости поощрения талантливого разработчика.